По одному кассовому чеку вычета НДС на расходы в командировке не будет

Если единственный документ для подтверждения расходов на проживание в командировке это кассовый чек, он не является основанием для получения вычета НДС. Письмо Минфина России от 26 февраля 2020 года № 03-07-09/13555.

Основную часть расходов на командировки составляют оплата проезда сотрудников до места командировки и оплата проживания в гостиницах. НДС по этим расходам можно принять к вычету - об этом прямо сказано в пункте 7 статьи 171 НК РФ.

Основанием для вычета НДС по расходам на наем жилья в командировке являются или счет-фактура и документы, подтверждающие уплату НДС (например, кассовый чек), или бланк строгой отчетности (БСО). БСО должен быть оформлен на командированного работника и иметь отдельную выделенную строку с суммой НДС.

А вот кассовый чек в отдельности не может быть основанием для вычета входного НДС. Поэтому его не регистрируют в книге покупок.